我看不出来它们有多么相似。

PHP 弱类型；Python 强类型。

PHP 主 Web；Python 主通用。

PHP 早期命名混乱、特性支持不全（Unicode、namespace）；Python 比它好多了。

PHP 扩展集中在 Web 开发。有爬虫么？有科学计算么？有大数据么？连进程控制都做不好。

PHP 语法越来越复杂了（跟 C++ 一样不断地加特性）；Python 相对干净不少。

PHP 连个像样的交互式 shell 都没有（我找到一个，是用 Python 写的）；Python 不仅原生就支持交互式 shell，还有 ipython、bpython、ptpython 等各种好用的东西，还有以数据分析为主的 notebook。

PHP 之前连 SQL 转义都搞不定的吧？Python 我刚认识的时候已经是 DB API 2.0 了，正确使用，完全不用担心 SQL 注入。

PHP 入目一堆美元；Python 更像普通的文本。

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PS: 为什么只说 PHP 的缺点、Python 的优势？因为我回答的是「PHP 为什么没有取代 Python」，不是「Python 为什么没有取代 PHP」！