单机海量哈希去重算法 财富值30

2016-10-12 23:43发布

单机环境,有大约1TB硬盘装满了md5哈希,里边有重复的,怎样才可能最快速度踢出重复的。内存大小限定为512MB吧

我实际遇到的一个问题,我去知乎提问了。居然被管理员封了,说我“代为解决个人问题”
https://www.zhihu.com/questio...

我把我知乎的回复抄过来

居然有人投诉说"代为完成个人任务",也是醉了。这个问题不是面试题,也不是啥个人问题。是我实实在在遇到的问题。我有个思路,实现也简单,但是预估计跑完得个把星期了。

现在有两T,1TB是数据,另外1TB用来存放结果。

我现在没有啥特别好的思路。只有最简单的优化。
分文件

A分区存1TB数据,B分区空闲

MD5hash 特点0~9a-f 总共16种情况 总共32个字符。

第一步分级
分两级

第一级 0·f 总公16个目录
第二级 0-f 总共16 个文件

那么这样下来我们总共会有256个文件

从A分区中顺序读取哈希,哈希的第一个字母情况根据目录进行分类;
哈希的第二个字母进行文件分类;对于任意一个A分区中的数据,会通过前两个字母定位
到这256个文件中的某一个;

顺序遍历A分区数据,完成全部操作之后会生成256个文件。

第二步
此时就转化成为将256个小一点的文件进行去重;

对于小一点的文件去重;

  1. 分块读入内存进行堆排序,进行一次顺序遍历则可以剔除重复数据;

  2. 对于两个已经分块的顺序数据合并去重;这种情况相当于“”有序单链表合并问题“”
    很容易做到;

  3. 依次重复1.2两步可以将这256个小文件去重;此时得到结果

这是我想的一个简单办法,但是估算了一下时间可能要个把星期。。。好久

友情提示: 此问题已得到解决,问题已经关闭,关闭后问题禁止继续编辑,回答。
7条回答

之前做过去除几百G的DNA序列中的重复序列,感觉和这个问题类似(假设你的文件一行一个hash),buffsize给的是30G(在集群上跑了一天),不知道你这个512M要跑多久...

一周热门 更多>